有限蛋白水解质谱技术（Limited Proteolysis Mass Spectrometry，LiP-MS）是研究小分子化合物（天然产物、代谢物等）与蛋白质相互作用，揭示蛋白结构动态变化的高通量质谱筛选技术。本公司推出LiP-MS药物靶点筛选解决方案，包含三种研究目的场景

无需设计合成分子探针；提供野生型细胞/组织和药物分子就可以进行实验；

使用药物分子在体外直接进行结合实验，得到直接结合靶点及其结合位点；

利用质谱技术的高通量性能，无偏见的数据驱动筛选保障获得真实的阳性结果，实现治疗靶点与脱靶靶点的全覆盖；

通过比较筛选、生信分析和数据库挖掘，报告直接给出推荐的靶点列表清单；

对潜在靶蛋白与药物分子进行分子对接，在计算机模拟层面给药物靶点进行验证；

LiP-MS药物靶点筛选

药物靶点研究最常见的场景是有了一个有效的药物，但是不清楚这个药物作用的具体靶点和机制。这个时候可以进行蛋白质组水平的LiP-MS药物靶点筛选。客户提供原始的细胞或组织及药物，谱度众合实验室在非变性条件下提取疾病模型细胞/组织中的全部蛋白，分别使用药物和溶剂进行处理，随后进行有限水解实验，通过质谱高通量筛选两组间差异肽段，实现在整体蛋白水平筛选药物作用的蛋白靶点。

1. 至少6个给药前样本（药物处理组3个，溶剂对照组3个；如需增加不同浓度或者不同药物处理组，每组增加3个样本）；

2. 单个样本起始细胞量建议>1*10E7（组织样本＞5mg）;药物用量：摩尔分子质量/10（μg），例如分子量1000的药物，需要100μg的量；或者20μL*5mM的药物溶液。

收集细胞/组织样本时需以PBS清洗干净，样本不含有任何去垢剂/变性剂成分。

LiP-MS药物-蛋白结合域分析

该产品应用于一个特殊的药物靶点研究场景：已经明确了药物作用的靶蛋白，但是不清楚药物作用在蛋白上的哪个位置（区域），可以通过对重组蛋白的LiP-MS实验来实现研究目的。客户提供纯化重组蛋白及药物，谱度众合实验室进行体外的重组蛋白和药物分子结合实验，随后进行有限水解实验，通过高分辨质谱来分析药物作用所产生的差异肽段，结合分子对接可以获得明确的药物-蛋白结合区域信息。

1.至少6个给药前样本（药物处理组3个，溶剂对照组3个；如需增加不同浓度或者不同药物处理组，每组增加3个样本）；

2.单个样本起始重组蛋白量建议>5μg（总量大于30μg，浓度不低于0.05μg/μL）；

3.重组蛋白溶液中不含有任何去垢剂/变性剂成分。

LiP-MS药物机制研究

该产品用于体内/活细胞给药条件下筛选药物靶点，同时提供药物进入机体/细胞后引起的生理/病理变化（蛋白表达变化），以提供药物作用分子机制。客户提供经药物/溶剂对照处理后的细胞/组织样本，谱度众合实验室分成胰蛋白酶直接处理的定量比较组和有限水解处理后的结构比较组。通过定量比较组可以得到药物处理下蛋白表达变化结果。结构比较组数据经过定量比较组校正之后得到药物作用后蛋白结构变化信息（肽段差异），进而筛选药物作用靶点蛋白。

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图4：LiP-MS药物机制研究实验方案

1.至少12个给药/溶剂处理后的样本（药物处理组3个，溶剂对照组3个；药物处理有限水解组3个，溶剂对照组有限水解组3个）；

2.单个样本起始细胞量建议>1*10E7（组织样本＞5mg）;

3.收集细胞/组织样本时需以PBS清洗干净，样本不含有任何去垢剂/变性剂成分。