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口腔癌专题带您熟悉蛋白质组学在临床研究中的应用(上)——文献横评之标志物发现
如何寻找更适合您的研究方式呢?本文分享的两篇研究论文聚焦于生物标志物的发现,特点总结如下:
整合蛋白质组学揭示了E3泛素连接酶SYVN1在肝癌转移中的作用
研究联合泛素组和全细胞蛋白质组学分析HCC的发生和转移,证明SYVN1是其中起作用的关键分子,然后通过构建细胞/动物模型进行功能的验证,探索可能的分子机制。但文章并未明确SYVN1、HSP90和EEF2K之间的关系以及EEF2K在HCC转移中的作用。
组织蛋白酶F和纤维蛋白-1作为非小细胞肺癌脑转移的新型诊断生物标志物
此项研究采用多个独立的队列来验证候选生物标志物,病例数量较多,并对其中部分病例进行了纵向观察,最终筛选出能够早期诊断、实时监测病情以及评估治疗反应的生物标志物——CTSF和FBLN1,可信度较高。如果本研究采用了更合理的蛋白质组学应用和分析方法,结合现有的大规模临床队列,本文应该会有相当程度的提升。
新型尿蛋白生物标志物组用于胃癌早期诊断
本文是一篇结合病例对照研究设计和蛋白质组学分析的文章,采用较大样本量进行训练和验证,最终确定胃癌早期检测的非侵入性生物标志物组合,对于提高胃癌的可治愈性有一定临床意义。
定量蛋白质组学揭示艾滋病并患非霍奇金淋巴瘤的血浆蛋白变化
本文采取的横断面研究设计,能够为疾病的病因和预后提供线索,适合于一个研究方向的起始阶段。进一步的研究中,可增加发现队列的样本量,采用多种关键蛋白的建模筛选方式,并用更大独立队列进行验证,以提高证据力度。
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